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操作時，班員全身都採取了防護措施，辨別不出穿在護衛服的人是誰。爲了防止菌從口入，作業時一言不發，彼此用手勢表達意思。
植菌後的培養基運回培養室。培養室屋頂是塊整銅板，若大的房間，只吊着兩盞電燈，顯得陰森暗晦。培養室內的溫度可以按照不同菌種的需要在二十度至八十度之間調節。培養室裏有一天之中就可繁殖的菌種，也有要花上一週才能形成的羣落（繁殖時不能用肉眼分辨的聚塊）。
菌種得到瓊膠的培養，在培養基的表面不斷繁殖，形成粘稠的乳白色羣落。將其中成熟的取出，這次用刮棒——白金制，長五十厘米，頭上有刮勺。——將培養基上浮起的羣落刮落到器皿裏，積在器皿底的羣落呈甜酒狀。這種粘糊糊的粘塊散發出獨特的氣味。
以上就是細菌製造工藝的一個週期。“收穫”過一次的培養基再放進高壓鍋徹底滅菌，可以繼續使用的就繼續作培養基，重複使用三次後就會失去再生能力，直到此時，解體了的瓊膠才丟棄。
柄澤班就用這種辦法大量製造鼠疫、傷寒、霍亂、赤痢、破傷風、結核、脾脫疽、麻瘋、瓦斯壞疽等細菌。
由於班員在操作中接觸活菌疫苗，常常有受感染的危險。不管怎麼小心，飄散在空氣中的活菌疫苗難免會進入口中。工廠裏到處都堆着蘋果，班員們每到一個作業區就咬上幾口蘋果，然後再吐掉，讓蘋果肉吸收細菌後排出體外。
“蘋果怎麼會吸狩猛的活菌疫苗呢？”棟居對這種原始的排毒方法感到驚訝。
“不過是心理安慰罷了。在製造細菌的過程中，柄澤班的許多班員都殉職了。我們的‘工廠’在口字樓一樓，沒有窗，三面是走廊，白天也是陰森森的，據說常常出現殉職隊員的幽靈。”
“沒有用檸檬代替蘋果嗎？”
