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碳基聯盟與硅基聯盟曠日持久的大戰已經持續了三個世紀，碳基聯盟爲了打破目前與硅基聯盟在每個宇宙戰場中僵持的戰鬥，幾位最高決策者最終決定啓動終極武器計劃。
歷經半個世紀，集所有碳基聯盟所有全成員星最高科技的終極武器——蓋婭，在銀河系中心地帶中誕生了。
蓋婭問世之後，碳基聯盟立刻派出一支艦隊護送，要將它護送至仙女座主戰場上的超新星級星際戰艦之上裝載使用，以希望對硅基聯盟的主要戰力造成重創，結束這僵持的局面和爲後來的勝利作奠定基礎。
不巧的是，硅基聯盟那超強力計算機破譯了碳基聯盟的超遠距離通訊中的信息。
爲此，他們派出了三支主力艦隊躍遷至碳基聯盟在銀河系的研發中心，對碳基聯盟造成了重大打擊。
突如其來的變故使護送“蓋婭”的艦隊根本來不及躍遷，艦長當機立斷以最高速度前進，打算將追兵甩掉之後再作躍遷。
三支硅基聯盟主力艦隊見有敵艦逃出，立刻派遣了其中一支無畏艦隊進行追擊，而他們則決定留在銀河系研發中心之中搜尋“蓋婭”的下落。
雖然護衛艦隊先行逃逸，但面對比他們速度更快的無畏艦隊還是很快被追上了。作爲硅基帝國利刃的無畏艦隊，他們快速地將敵艦隊用光束粒子炮摧毀得只剩下主艦了。
而護衛艦隊中這個剩下名爲“銀星號”的主艦，就是承載了蓋婭的艦船。若他們失敗，那碳基聯盟將會在很長的一段時間內進入內亂！
因爲光製造“蓋婭”就動用了全部成員國的頂尖科研人員，耗費的稀缺資源和心血都是不可估量的。
