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成功控制能量水晶後，遠征隊在新大陸的遺蹟中建立了一個臨時基地，以便深入研究這一神奇的能量來源。科學家們圍繞着能量水晶展開了全方位的分析，他們發現水晶蘊含的能量遠超想象，其能量結構複雜而精妙，與地球上已知的任何能源形式都截然不同。
然而，隨着研究的深入，一些奇怪的現象開始出現。能量水晶似乎在與周圍的環境產生某種交互，遺蹟中的一些古老機械裝置在能量水晶的影響下開始自動運轉。這些機械裝置的啓動引發了一系列連鎖反應，大陸上的氣候和地形都發生了微妙的變化。原本平靜的天空時常出現神祕的能量波動，遠處的山脈也有輕微的震顫。
林羽意識到這些變化可能帶來未知的危險，他組織了一支偵察隊，去周邊地區調查情況。偵察隊在遠行過程中發現，大陸上的一些原本處於休眠狀態的生物在能量波動的刺激下逐漸甦醒。這些生物形態各異，有的體型巨大如恐龍，有的則小如昆蟲但卻擁有強大的攻擊力。它們的行爲變得異常活躍，對遠征隊的臨時基地構成了潛在威脅。
回到基地後，偵察隊向林羽彙報了情況。林羽決定加強基地的防禦，並派遣一部分隊員去研究如何穩定能量水晶的能量輸出，避免引發更劇烈的環境變化。
在防禦準備過程中，那些被喚醒的生物開始向基地發起攻擊。青年再次站在防禦前線，他指揮戰士們利用臨時搭建的防禦工事與生物戰鬥。他們使用了從神祕島嶼和之前戰鬥中積累的經驗，巧妙地應對各種生物的攻擊。少女則在基地周圍運用她的感知能力，提前預警生物的突襲方向和規模，爲防禦作戰提供關鍵信息。
與此同時，研究能量水晶的科學家們有了新的發現。他們發現能量水晶的能量可以通過一種特殊的頻率進行調製，從而實現穩定輸出。但要實現這一目標，需要找到與這種特殊頻率相匹配的媒介。在遺蹟的深處，他們找到了一些神祕的晶體碎片，經過試驗，這些碎片似乎就是他們要找的媒介。
