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聯盟高層下達全面排查的命令後，整個聯盟內部立刻進入了高度緊張的狀態。安保部門聯合情報部門，組織了大量的人力物力，對聯盟總部以及各個附屬星球、基地等區域展開了地毯式的排查工作。
排查人員分成了無數個小組，深入到每一個角落，從人員密集的生活區，到存放重要物資和設備的倉庫區，再到各種科研、軍事設施所在的區域，無一遺漏。他們仔細檢查着每一個人的身份信息、工作記錄以及日常行爲軌跡，同時運用各種先進的探測設備，查找是否存在隱藏的間諜裝置或者異常的能量波動跡象。
在這個過程中，不少正常工作和生活的聯盟人員也受到了影響，日常的活動被打亂，需要配合排查人員進行反覆的詢問和檢查，但大家都明白事情的嚴重性，沒有絲毫怨言，都希望能夠儘快揪出那些潛藏的間諜，還聯盟一個安全穩定的環境。
然而，這一排查工作並非一帆風順。邪惡勢力得知聯盟正在進行全面排查後，爲了保護他們安插在聯盟內部的剩餘間諜，開始在聯盟外部製造各種混亂，試圖分散聯盟的注意力，干擾排查工作的進行。
他們派出艦隊在聯盟的一些貿易航線附近再次發動襲擊，這次的襲擊規模比之前更大，手段也更加兇殘。星際海盜們在邪惡勢力的支持下，組成了龐大的海盜聯軍，肆無忌憚地攻擊聯盟的運輸艦，不僅搶奪物資，還殘忍地殺害船員，許多運輸艦在海盜聯軍的猛烈攻擊下被打爆，殘骸漂浮在宇宙中，場面十分慘烈。
同時，邪惡勢力還暗中挑唆一些原本中立的勢力，利用之前散佈的謠言餘波以及各種利益誘惑，鼓動他們對聯盟採取敵對行動，使得聯盟周邊的外交局勢變得越發緊張起來，聯盟不得不分出一部分精力去應對這些外部的威脅，從而在一定程度上影響了內部排查工作的進度。
