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1915年10月，日本國內突然爆發大規模的鼠疫，先是出現在沿海地區，至11月即傳至東京大阪神戶等大城市，之後疫情如江河決堤般蔓延開來，不僅橫掃整個本州島，而且波及到了朝鮮及北海道地區。好多地區的居民往往一人患病，不久即全家喪命。爲了防止疫情擴大，日本政府出動大量兵員警察估價焚燬疫情較重的地區的房屋和屍體，但鼠疫也很快傳到了執行任務的人員當中，很多人染病身亡。一時間日本各地從城市到鄉村，全都籠罩在死亡的陰影之中。
鼠疫出現後，日本政府立即嚴令各地防範疫情擴散，頒佈了各項嚴酷的防疫法規，採取了隔斷疫區交通，建立大量的隔離區，組織人力焚化病人屍體，對疫區進行嚴格消毒等種種措施，但由於疫情擴散過快，日本政府事前又毫無準備，結果導至了大量的人死亡，很多人爲躲避鼠疫，紛紛乘船逃離日本，結果不可避免的使疫情擴散到了朝鮮和有大量日本移民居住的夏威夷地區。
由於此次鼠疫來勢兇猛，在擴散到朝鮮之後，以朝鮮爲基地的侵華日軍也遭到了傳染，很多士兵染病，日軍減員嚴重，由於中國軍隊的不斷反擊，日軍難以招架，開始迅速後撤，竭力脫離同中國軍隊的接觸。
1915年12月7日，日軍全部退入朝鮮境內，中國軍隊收復奉天全境，同日軍隔鴨綠江對峙。
1915年12月9日，在英國和美國政府的聯合調停下，中日兩國於當日宣佈停火。
1915年12月27日，奉天發現鼠疫疫情，中華醫學會書記伍連德博士率醫療團前往視察調研，並被北京政府授予防疫指揮協調全權，負責撲滅鼠疫。中國各省紛紛組織醫療人員前往奉天。
1916年2月7日，在美國方面的努力下，夏威夷疫情被撲滅，據美國政府不完全統計，夏威夷共計有約3萬人染病死亡。
1916年3月12日，中國政府宣佈奉天疫情被完全撲滅，確定有2543人染病死亡。
1916年5月2日，日本政府宣佈境內鼠疫全部消除，日本官方公佈死亡數字爲133476人。而據一些在日本參加防疫工作的外國專家透露，日本官方出於政治目的，蓄意隱瞞了死亡人數，外國專家們保守估計的死亡人數超過50萬人。
