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莊巖、張鰹等人的態度改變讓對福建水師的招納有了明顯效果，首先張鰹作爲遊擊將軍，在福建水師中職位不低，原本就有一班可靠的部下，張鰹和其餘兩個軍官一起投靠朱怡成，他們原本手下的那班人幾乎全跟着一起投了過來。再加上福建水師中本就鄉黨衆多，何況還有莊巖出面勸說，一來二去被俘虜的水師兵丁90%都放棄了官軍身份，投入義軍中。
至於還剩下來的那些人，有些是跟着莊巖等不肯投效的，還有些是牽掛老家怕投了義軍連累家人的。但不管怎麼說，這些人的數目已經翻不起浪花，就算暫時把這些人和之前那樣養着，對於朱怡成來講也不是大不了的事。
福建水師的投靠，使得朱怡成實力猛然大增，畢竟福建水師和義軍不同，這可是清軍中的精銳部隊。但有一點，朱怡成對於如何運用投來的福建水師也有自己的考慮，這些人絕對是不能直接使用的，福建水師戰鬥力強是不假，但這戰鬥力除了平日的訓練和火器的優勢外，關鍵一點還在於福建水師中的鄉黨派系。
中國人是一個講究關係的國度，同樣也是鄉黨氣氛濃郁的國家。自古以來就是這樣，這種情況直到近代也都未有什麼改變。早在前明時期，赫赫有名的盧象升所率領的天雄軍就是如此，整支天雄軍都是老鄉、父子、兄弟、朋友組成，往往一人戰死，整支軍隊同仇敵愾，從而激發出無窮的戰鬥力。而在近代，桂軍、西北軍等也是如此，這種軍隊的組織結構註定了他們擁有其他軍隊所沒有的士氣和優點，但作爲鄉黨組成的軍隊同樣也有其無法避免的缺陷。
比如說排外嚴重，又比如指揮結構僵化，再者還容易在軍中形成山頭派系等等，不利於上層直接對部隊的掌控。對此，朱怡成要用福建水師，但又不能直接拿來用，作爲一把利刃，只有實實在在握在自己的手裏纔是一把好刀。
針對收歸己用的福建水師，除了留下一部分人組成一營外，其餘大部分兵丁，包括低級軍官全部拆散，同現有的義軍進行混編。至於留下的一營人，主官也由義軍的千戶來擔任，原本的各級官員在部隊中擔任副職。
另外，依靠福建水師的精銳來幫帶和訓練義軍，用最短的時間把這些人在義軍內部進行消化。至於像張鰹這樣的將領，雖然由於他的原因導致福建水師戰艦落入朱怡成之手，但從海戰的經驗來講，張鰹卻是一個非常合格甚至優秀的將領，要不然施世驃也不會特意派他留守戰艦。
如今的寧波義軍在得到福建水師全部戰艦再加四海商行的大量船隻後，其海上實力可以說是首屈一指。可這些只不過是表面上，海戰和行商是不同的，就算擁有足夠數量的水手，再加上這些戰艦也不可能形成和福建水師戰敗前的那種戰鬥力。
