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所謂的神代模式，其實是最初四郎他們研究的阿修羅查克拉模式。
原本的阿修羅查克拉模式，是以特定的方法，將信賴自己的人的查克拉集中並昇華，從而爆發出更強的力量！
但當這招研究完成後，出現了一個問題。
按照四郎的計劃，不論如何發展，最終決戰的時候，查克拉是不能存在的，至少忍界大部分人不能擁有，不然神樹復甦時，會因爲要收回所有查克拉而暴動。
所以這樣就有了另一個問題，查克拉都沒了，查克拉模式練來幹什麼？
因此，四郎他們重新思考了另一條路線，那就是，不集中忍者的力量，而是世界的力量！
最終，經過幾人不斷的研究，成功將人與人的連接方式，轉化成了人與世界的連接方式！
當然，這一步只是開始而已，後面的纔是重點，要如何才能讓世界信任你，將力量分享給你，你又要如何運用這股力量，你是否承受的住等等。
而當這一系列的問題全都解決掉之後，水門的神代模式就出現了。
神代模式，可以像神代魔術師一樣連接大源，使用大源的力量，但不同的地方在於，神代魔術師輸出的魔力基本是固定的，這和他們的魔術迴路相關聯。
