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首先，櫻滿黑周研究虛空基因組目的何在，這是決定性的一環。h口中得知，自己還未出生的兒子，竟然被寄生在女兒身上的病毒選爲下一任的亞當，親姐弟之間結合破壞了倫理綱常，這種痛苦不亞於喪妻之痛。所以他爲了控制天啓病毒，拯救兒子，潛心研發虛空基因組，天啓病毒疫苗就是建立在虛空基因組之上研發出來的副產物。
從遊戲裏看，斯庫路基死後留下的右手，是促成基因組完成的奠基石。而斯庫路基本人除了抽取卡洛爾的虛空外，無論抽取誰的虛空，結局都是晶體化，所以在他右手中遺留的基因並不正確。在黑周設想中，王的能力應該是完全抽取天啓病毒，同時對使用者本身無害。繼承了黑周遺願的春夏自然注意到這點，所以在王明筆下，春夏對虛空基因組進行了重新設定。
最後，櫻滿集爲什麼要叫紅眼睛的病毒體真名爲怪物，這是破局的關鍵。在原版動畫中，幼年時期的櫻滿集是出於害怕的心理，將真名喚作怪物。長大以後，因天啓病毒加諸在身的不幸，又因病毒體真名對楪祈的踐踏，才吼出這一聲怪物。如同發泄，他沒考慮太多，因爲集在這時已經決定勝利後，奉獻自己吸取天下所有天啓病毒，用自己的生命終結這亂世。
但這裏其實是一個轉折點。楪祈重要，姐姐也一樣。回想起過去記憶的櫻滿集如果不帶着毀滅一切的想法，而是試着去接納姐姐，那麼結果會是什麼樣呢所以這裏是世界線變動之三。
明白這兩點以後，動畫結局就有了可操作空間。
集嘴炮策反了涯，兩人準備握手言和。h突然出現，出其不意地抽取了病毒體真名的虛空，準備強制執行第四次默示錄。
一番苦戰，最終集利用涯創造出來的機會，將全世界病毒注入到daath體內，他的身體逐漸晶化，最終化爲結晶消散一空。而以虛空基因爲紐帶復活的涯，在體內病毒消失後，身體開始崩解。
櫻滿集想對慢慢消散的姐姐說聲對不起，然而真名卻捂住集的嘴，最後在一個不捨的吻中，說了句“傻瓜”，倒在櫻滿集懷裏。
動畫的最後，是一個粉頭髮少婦，她前面有個小女孩在跑。小女孩邊跑邊笑着說：“媽媽快來追我”。
