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索馬里屬於世界漁業非常豐富的國家之一，據估計，年捕撈量可達25萬噸，但因受捕撈方式落後，市場銷量不大等因素的限制，年捕撈量僅有2萬噸左右。由於索馬里沒有強有力的中央政府，外國漁船在索馬里領海偷捕現象嚴重。索馬里部分派別也向外國漁業公司出售捕魚許可證。
又因爲海盜的原因，許多索馬里漁民根本無法出海，不是因爲海盜，而是因爲打擊海盜的國際力量。只要是索馬里漁船，一出海必將面臨各種刁難，許多漁民被臆斷的畫上海盜的標緻，運氣不好的連漁船也會被銷燬。
所以，儘管有豐富的漁業，但是由於種種原因，自家領海和專屬經濟區內的漁業，其實都是其他國家的。
索馬里主要經濟支柱，其產值約佔國內生產總值的40。主要養殖牛、羊、駱駝等，2012年畜牧產品出口佔出口總額的85。
交通運輸業落後，境內以公路爲主，無完好能運行的鐵路。
公路：主要公路全長15215公里，其中柏油路2880公里，除索馬里蘭境內的部分公路外，大都年久失修。內陸交通運輸主要靠汽車和駱駝。
水運：海上運輸佔重要地位，主要港口有南方的摩加迪沙和基斯馬尤，北方的柏培拉和博薩索。由於南方時有戰鬥，北方兩港承擔主要海運任務。不過由於碼頭設施落後，吞吐量十分有限。
空運：有大小機場61個，絕大部分條件簡陋，跑道未經鋪墊。摩加迪沙和柏培拉有國際機場，可起降大型客機。2001年重建國家航空公司－－索馬里航空公司，但索馬里蘭和邦特蘭均不允許其飛機在兩地起降。
2001年3月，埃塞航空公司開通了從亞的斯亞貝巴飛往索馬里蘭首都哈爾格薩的航班，每兩週一班。此外，聯合國運送援助物資的飛機也經常在索馬里起降。
