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故事講述到擊敗小丑皇后，最後的黑暗數碼寶貝——在進化途中消失的數碼寶貝邪念的集合體出現，破壞了徽章，還將孩子和數碼寶貝們都分解成了數據。在數碼寶貝的鼓勵下，孩子們明白，徽章所顯示的正是她們的心，找回自信，重回戰場。
在《數碼寶貝》進化插曲“勇敢的心”的伴奏下，數碼寶貝們紛紛進化。
“不管是誰，都有想去逃避的時候。”
這一刻，孩子們紛紛乘上了數碼寶貝，向黑暗數碼寶貝發起了衝鋒。
“只要在那一刻發揮出潛藏的那種力量，便可以清除路上的障礙。”
黑暗數碼寶貝的觸手襲向孩子們，但是孩子們互相掩護，各自的數碼寶貝大顯神威，觸手一一擊潰。
“一定有些什麼事怕是你才做到的，使這個藍色星球，可以繼續閃耀着光芒。”
孩子們的眼中閃耀着明亮的光芒，那是希望與不屈的鬥志！
“抓緊着！你所擁有的夢想；守護着！你重要的朋友；衝刺！比風還要快的速度；去吧！比天空還要遠的地方。”
