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所以在電波觀測所的那次，鳳王就是因爲這事纔不肯說出，它們在遠古時期時爲什麼不阻止超能帝國的計劃。
而這一切的根本原因就是，神獸被超能帝國的話給欺騙了，進而它們將身上的部分力量贈予了超能帝國，然後超能帝國研究出一種對付神獸的武器，同樣也進行了超能計劃的研究。到那時，神獸們才意識到自己被騙了，可那時已經晚了，神獸們想要去毀滅超能帝國，卻被擊退而歸，並且還是重傷離開超能帝國，開始漫長的沉眠療傷。
最後，要不是“世界初始之樹”裏的“夢幻”使用世界之樹的力量與那些足以殺死神獸的武器進行對抗，毀滅了那些武器，才得以阻止超能帝國的野心。
根據這些分析，小智也知道了世界之樹爲何會毀滅，只因，它爲了毀滅那些武器，耗盡了大量的力量，才因而造成世界之樹的毀滅。
雖是如此，但超能帝國的野心沒因此泯滅，反而是利用剩餘了一點力量，再次研究起武器與開始進行超能計劃的實驗。
可是，現如今已經沒有神獸來阻止了，而力量耗損過度的世界之樹也無法阻止，只能任由他們繼續下去，但他們的超能計劃到至今爲止都還沒研究成功，這都是因爲科技不夠發達，神獸的力量過少，不夠利用，導致他們到現在爲止實力沒得到大漲，但也穩居於數個帝國中的第一帝國的位置。
現在。
小智打算徹底地破壞這個實驗，從而，永絕以後的黑化精靈事件，雖然他很想在這次機會滅掉聯盟的前身超能帝國，可實力不允許他這樣，一旦他自不量力地去對抗帝國，那下場必定會相當悽慘。
“耿鬼，你偷偷潛進去，使出幻象術。”小智帶着皮卡丘爬到夜魔人的手上。
