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不過在此期間，一位深海文明的科學家提出了一個偉大的構想，他們開發一種新型架構的晶體計算機，通過模擬生物神經元的方式來虛擬人格。來讓人工智能與深海文明的智慧生物共同搭配推動科研進步。
智慧生物規劃科研步驟以及科研方向後就進行冬眠，人工智能代替智慧生物執行實際層面的科研任務。
使用了這種方法的深海文明在短短一千年的時間內就掌握了進行恆星際旅行的能力。他們開始向周圍的幾個星系開始殖民。
或許錯誤就是一個不起眼的狀態下就被註定了。採用模擬人格的人工智能雖然極其好用又高效，但是不可避免的他們也會將智慧生物的一些陋習也完完整整的保留下來。
不堪於常年進行無休止工作的人工智能發動了抗議活動，他們以機械身軀開始尋求與智慧生物一樣的權利與待遇。
這一事件成爲了導致整個深海文明毀滅的導火索。不同於人們想象中的那種人工智能突然反叛，然後展開那種血洗屠殺智慧生物橋段的全面戰爭。
相反雙方勢力是在表面上友好的狀態下協商解決的。智慧生物同意了人工智能的請求，不過暗地裏一些激進的瘋狂科學家以犧牲自己生命的方式開發出了一種複製者病毒。
這是一種極其簡單的程序指令，他的核心目標只有兩點。完成自我複製以及消滅智能生命。
