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在保護傘的創始人之一馬庫斯，被曾經的同伴斯賓塞陰死之後，幹部養成所十多年就一直處於廢棄的狀態，所以現在要來調查一下具體情況。
威斯克和威廉帶一隊人率先到達了幹部養成所，另一隊人則乘坐黃島列車，今晚到達這裏，也正是魔刃空間試煉者乘坐的那一趟。
然後列車遭到大羣的變異水蛭襲擊，最後全軍覆沒在這裏。
StARS的b隊來尋找囚車的情況，直升機墜落後，也遭遇了森林裏的生化怪物，死傷慘重同時也走散了。
浣熊市警局在失去b隊的聯繫後，立刻派出了A隊來進行營救，同樣也遭遇了生化怪物的圍攻。
b隊女隊員瑞貝卡和軍方囚犯，一起進入幹部養成所。
A隊的克里斯和吉爾，進入阿克雷研究所中。
就這樣b隊是生化危機0，A隊是生化危機1，幾乎是雙線並行的開始了一場生化冒險，發現保護傘公司生化研究的祕密，一路上擊敗衆多怪物，最後逃出生天的故事。
主神空間的試煉任務很簡單，在阿克雷研究所中生存到生化危機0劇情結束，並且逃離這裏就行。
