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《宇宙第二次鉅變》的理論根據來自於《統一信息論》及該書的第二版《紫薇星明》。以下是該書的理論簡介
宇宙是自在的、純真的、清澈透明的，本無任何超自然性，一切一切的神奇僅在於人類認知的貧乏及人爲的“神化”。
人類認知水平是不斷提高增進的，因而宇宙沒有絕對不可認知的自在之物，也並沒有所謂的無法認知的暗物質、黑洞等，它們只是相對當下的人類認知水平而言的稱謂。合理的認識方式及知識體系能夠觸及到宇宙所有事物的最底層，故合理的認知體系一定是全域統一的完全性大統一理論。但合理的認知體系需人類發展到一定水平時才能建立，特別是當人類認知發展到新文明方式時，宇宙將顯得漸漸清澈透明，此時才具備建立完全性大統一理論體系的條件。
就認知總論而言，哲學是人類認知的1.0階，現代科學是人類認知的1.5階，統一信息論則是人類認知的2.0階。本書爲《統一信息論》的第二版（2.0版），爲宇宙萬象的認知總論，知識形態爲完全性大統一理論，寫作方式以理論物理爲主導。此書可謂新物理學，可謂宇宙學，可謂新生命學，可謂新哲學，可謂新人文理論，可謂新宗教理論，但最重要的稱謂是認知總論，是典型的完全性大統一理論。
《紫微星明》仍然採用了統一信息論的認知方式和知識體系，但內容更豐滿、框架更完善。一如“統一信息論”，該書仍然以信息作爲始基構建而成，具備終極理論的典型特徵，主要包括信息本原論、極限粒子論、主體程序論三位一體的系統理論。此外還包括“統一信息論時空觀”、“統一信息論宇宙觀”和“新文明認知方式”3個核心部分。
（1）信息本源論首先論述了信息結構、認識的客觀性、客觀存在的形成等基本問題，解釋了信息（能量子）對於宇宙萬物的始基作用。
（2）極限粒子論揭示了作爲物質極限單元體的極限粒子所構成的物質最基礎層面，說明了物質的質量、時間、空間是基於極限粒子而形成的理論依據，論述了宇宙所有事物及其現象都是基於極限粒子形成和分解的根據。
（3）統一信息論時空觀解讀了統一信息論意義上的空間與時間的實質，揭示了四大作用力的時空假象，不僅徹底顛覆了近代以來以牛頓爲代表的絕對時空觀，而且也完成了對現代科學理論的時空觀的超越。
