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等麴菌增殖完畢，麴菌的菌絲便開始發育，開始分解豆和麥。
這過程一般需要三天，整個過程中麴菌會釋放出大量的熱，必須時刻觀察，及時人工干預，將溫度保持在40度以下，不然將來得到的就不是醬油，而是臭臭的納豆——在40度以上，納豆菌等雜菌會更加活躍，但也不能低於24度，不然麴菌會停止發育或是乾脆死掉。
等這過程完成之後，就得到了“麴”，這時便可往裏加鹽水，由未來需要的鹹度決定，量通常是“麴”的1.2倍——這一步如果改成加鹽粒，將來成品就會是味噌。
等加完鹽水後，便可以將“鹽水麴”裝入木桶或瓦缸熟成，時間至少要一年，但這一年時間並不是不管它了，而是要不斷檢查攪拌，注入空氣，以保證微生物存活。
古代釀造師主要日常工作，其實就是“我該怎麼保證微生物活着，還心情很愉快”，裏面有很多小技巧，比如用木桶還是瓦缸，夏天多久攪一下，冬天要不要用稻草包起來，下雨天要不要多攪兩下，天氣太熱了是不是要降下溫等等，通常就是所謂的“家傳祕技”。
等一年之後，微生物們幹完活了，這時便可以把缸裏的東西倒出來，用布包裹好，然後壓榨，榨出來的就是帶各種微生物的生醬油，隨後再把生醬油加熱煮沸，把微生物殺死，就得到了最終成品——醬油。
醬油的具體釀造工藝阿滿可能不清楚，畢竟她的職業是“原始忍者”，不是藏人匠，但大概過程她還是知道一點的，深知這是個辛苦活，要花一整年時間不說，還需要大量的“家傳祕技”，傳兒不傳女的那種，覺得原野想賺這份錢真是異想天開。
但原野頭太鐵，非要去幹她也沒辦法，已經準備了一肚子詞，想了好多騷話，準備邊幹邊叨叨他是個敗家子，整天就知道浪費，但沒想到原野完全不按套路來，讓她無話可說，差點當場憋到腦梗——原野在幹什麼，她根本看不懂，完全和她以前見過的醬油釀製過程不同。
原野先是指揮衆人將豆餅、蕎麥殼、稻穀殼都扔進了幾口大缸裏並加入大量的水，然後淋澆了少量氣味刺鼻的液體並指揮桃井兄弟戴着口罩不停攪拌，等拌勻了，又將缸直接抬到壘好的土竈上用小火燒。
