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多順反子能和核糖體小亞基上的16srrna的3端富含嘧啶核苷酸的區域配對結合，有助於帶有甲酰甲硫氨酸的起始trna識別rna上的起始密碼aug，使肽鏈合成從此開始。這段順序是1974年由j夏因和l達爾加諾發現的，所以稱爲sd順序，也稱核糖體結合部位。原核生物rna的編碼區一般編碼幾種功能上相關聯的蛋白質，兩種蛋白質的編碼區之間常有一小段不翻譯的順序，叫做間隔區。
有的噬菌體rna中2個相鄰的順反子共用一段相同的編碼順序，例如，噬菌體rna中的溶菌蛋白編碼區共225個核苷酸中有189個核苷酸是由相鄰兩個蛋白質共用的。原核rna與真核rna一樣使用同一套三聯體密碼子真核生物線粒體rna有例外。原核生物合成氨基酸的操縱子rna的5端前導順序上有一段順序稱作弱化子。弱化子具有兩種可以互變的構象，其中一種構象是轉錄終止的信號，能使轉錄中止或衰減。衰減調節是原核生物合成氨基酸的調控方式之一。
真核生物rna細胞質中的一般由5端帽子結構、5端不翻譯區、翻譯區編碼區多順反子
多順反子、3端不翻譯區和3端聚腺苷酸尾巴構成。分子中除g構成帽子外，常含有其他修飾核苷酸，如a等。5端帽子結構通常有3種類型，即:g5ppp5n;g5ppp5n和g5ppp5n。圖1b[真核生物rna結構示意圖b5端帽子結構式，表示鹼基，表示鹼基是帽子的化學結構，n右邊的代表核糖2位羥基的甲基化。真核細胞線粒體中的rna無帽子結構。一般認爲帽子的功能與翻譯的啓動有關。許多真核生物rna如珠蛋白rna除去帽子後翻譯效率大大降低。5端不翻譯區。也叫前導順序。不同的真核rna的前導順序長度不同，有的只有10個核苷酸，有的則有200個核苷酸。與原核rna相似。真核rna5端不翻譯區中常有一段順序與核糖體小亞基上的18srrna的3端的一段順序互補並結合，這種結合與真核rna的翻譯啓動有關。
翻譯區編碼區使用的密碼子除線粒體如人、牛和酵母線粒體外與原核生物rna是一樣的。真核生物rna的起始密碼子都是aug。真核和原核生物rna使用的密碼子也都有‘簡併現象‘。即幾種不同的密碼子翻譯出同一種氨基酸，但不同的rna中簡併密碼子的利用率是不同的，真核與原核生物之間的差別就更大。rna的終止密碼子有3個uag、uga和uaa，其功能是停止翻譯，一般只用一個終止密碼子就能使翻譯停止。有的rna有2個連續的終止密碼子見。
3端不翻譯區的長短在不同的rna上有所不同，β珠蛋白rna只有39個核苷酸，而卵白蛋白rna則有637個核苷酸。真核生物rna3端不翻譯區常有aauaaa或auuuaa等順序，它們和識別多聚a聚合酶及裝配多聚a尾巴有關。除個別組蛋白rna外。真核生物rna3端均有多聚a尾巴3端多聚a尾巴的長度隨來源不同而不同，且隨rna的老化而變短，通常有20~200個a多聚a與rna穩定性及rna從細胞核轉到細胞漿中有關。
多順反子描述的是一個新型的表達系統，用以從一個單一多順反子構建體中產生目的多基因產物。尤其是，該表達系統包含一個多順反子載體，能夠在真核宿主細胞中表達功能抗體，其中載體在5′-3′方向上至少包含下面的可操作連接的元件:在真核細胞可操作的啓動子;編碼至少抗體輕鏈可變區的dna序列;內部核糖體進入位點ires;以及至少一個編碼抗體重鏈的dna序列。也公開了包含多順反子表達載體的哺乳動物細胞，和一種在用多順反子表達載體轉染的哺乳動物細胞中產生功能抗體的方法。
